PTMplus™ | 修饰蛋白质组学检测分析
PTMplus™ | 修饰蛋白质组学检测分析,精准定性定量检测样本间蛋白质翻译后修饰差异。
翻译后修饰(Post-translational modification,PTM)是指对翻译后的蛋白质进行共价加工的过程。它通过在一个或多个氨基酸残基加上修饰基团,可以改变蛋白质的理化性质,进而影响蛋白质的空间构象和活性状态、亚细胞定位、折叠及其稳定性以及蛋白质-蛋白质相互作用等。蛋白质翻译后修饰的丰度变化在生命活动研究中具有重大意义,异常的翻译后修饰会导致多种疾病的发生。翻译后修饰类型包括不限于:磷酸化、泛素化、N-糖基化、乙酰化、琥珀酰化、丙酰化、戊二酰化、丙二酰化和甲基化等。
实验及服务流程:
售前咨询→样本采集→样本质控→蛋白提取→肽段酶解→修饰肽段富集→HPLC分离→质谱检测→数据分析→报告发送→售后支持
结果示例图:
火山图
(横轴为变化倍数Fold Change的log2值,纵轴为以P值的-log10变化值,根据显著性变化的阈值为分界线,将数据主要分为三大类,红点为上调、蓝点为下调、绿点为没有变化)
差异蛋白聚类热图
(横坐标是样品名称,纵坐标是蛋白ID,用颜色的深浅表示蛋白质表达量的大小,从差异蛋白聚类热图可以看出样品间蛋白差异表达模式聚类)
GO富集柱状图
(横轴表示GO三个大类:细胞组分、分子功能、生物过程的富集结果,纵轴表示与该GO相关的差异蛋白数目所占百分比)
KEGG富集柱状图
(横轴为KEGG富集的通路,纵轴为富集到相应通路的蛋白质比例,颜色深浅表示P值的大小)
KEGG富集通路图
(蓝色框标记的是KEGG通路中表达下调的差异蛋白,红色框标记的是KEGG通路中表达上调的差异蛋白)
差异蛋白KOG富集柱状图
(使用KOG数据库对差异蛋白进行功能分类注释,横轴表示 KOG 分类,纵轴表示属于该类别的蛋白数量)
蛋白互作网络图
(通过匹配STRING数据库得到的蛋白质之间整个互作网络图,每一个节点代表一个蛋白质, 不同颜色的连线表示不同的相互作用类型)
应用领域:
1. 细胞自噬和细胞周期相关研究
2. 肿瘤及多种疾病致病分子机制研究
3. 信号通路及新药筛选相关研究
4. 生长及发育相关研究
5. 植物抗盐抗逆和农业水产相关研究
更多应用领域及其他技术问题,详情请咨询售前技术支持,联系电话/微信:17349797961