WTseqX™ | 全转录组检测分析

      WTseqX™ | 全转录组检测分析，精准定性定量检测分析样本间差异mRNA和非编码RNA。

      全转录组是指特定组织或细胞在特定状态下转录产物 (mRNA、LncRNA、CircRNA和microRNA) 的集合。全转录组测序可以对同一个样品同时进行mRNA、LncRNA、CircRNA 和 microRNA 的单独分析，还可进行多种 RNA联合分析以及内源竞争性RNA整合分析，分子标记筛选等，进而探究其潜在的调控网络机制，揭示转录调控问题。

       实验及服务流程：

       售前咨询→样本采集→样本质控→RNA提取→文库构建→illumina测序仪上机检测→数据分析→报告发送→售后支持

        结果示例图：

样品相关性检验图

（用皮尔逊相关系数表示样品间LncRNA的表达水平相关性，相关系数越接近1，表明样品之间表达模式的相似度越高。通常，相关系数在0.8-1之间属于极强相关，如果生物学重复的样本之间相关系数低于0.8，表示样品之间的相关性较低。）

样本鉴定得到的LncRNA Upset图

（number in each set表示每个样本鉴定到的全部LncRNA的数目；number of each intersection表示多个样本鉴定到的共有LncRNA的数目；横坐标一个点表示该样本鉴定到的特有LncRNA的数目；横坐标多个点连线表示连线的多个样本鉴定到的共有LncRNA的数目。）

差异表达 LncRNA 的火山图

（横坐标为log2FoldChange，纵坐标为 -log10（p-value）。图中两条竖虚线为2倍表达差异阈值；横虚线为 P-value=0.05 阈值。红点表示该组上调LncRNA ，蓝点表示该组下调LncRNA ，灰点表示非显著差异表达LncRNA 。）

基因组圈图

（最外圈是染色体条带，从外向内为不同差异分析的差异表达分析结果。红色和绿色分别为上调和下调基因的 log2FoldChange 值的柱状图，灰色为无差异表达基因的 log2FoldChange 值的散点图。）

 CircRNA 类型分布图

（横坐标表示样品名称，纵坐标表示不同类型的CircRNA计数，不同颜色代表不同类型CircRNA）

miRNA 首位碱基偏好性图

（横坐标表示不同的miRNA长度，纵坐标为不同长度的miRNA首位上的不同碱基，出现的频率百分比。）

mRNA GO富集分析柱状图

（横坐标为Go level2等级的term，纵坐标为每个term富集的-log10（p-value），柱子上的数目为富集到该term的差异基因个数。）

 KEGG 富集分析气泡图

（横轴Rich factor指该pathway 中富集到的差异基因个数与注释到的差异基因个数的比值。Rich factor越大，表示富集的程度越大。纵轴是KEGG通路名称，FDR一般取值范围为0-1，越接近于零，表示富集越显著。）

InDel 统计图

（InDel可能造成移码突变，导致mRNA 翻译时遇上一个错误的终止密码子。横轴为样品名称，纵轴InDel 为数量，Homo表示纯合子变异体，即这一位点的等位基因都突变了，并且突变相同，Hete表示杂合子变异体，即这一位点的等位基因至少有一个突变了，且突变后等位基因不同。）

        应用领域：

        1.  疾病致病机理研究

        2. 药物靶标相关研究

        3. 发育和进化相关研究

        4. 免疫相关机制研究

        更多应用领域及其他技术问题，详情请咨询售前技术支持，联系电话/微信：17349797961