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M16S™ | 16S微生物组学检测分析

 

 

      M16S™  | 16S微生物组学检测,系统分析样品间微生物群落组成差异。

       

      16S rRNA位于原核细胞核糖体小亚基上,包括10个保守区域和9个高变区域,其中保守区在细菌间差异不大,高变区具有属或种的特异性,随亲缘关系不同而有一定的差异。16S rDNA扩增子测序(16S rDNA Amplicon Sequencing),通常是选择其变异区域,利用保守区设计通用引物进行PCR扩增,然后对高变区进行测序分析和菌种鉴定,16S rDNA扩增子测序技术已成为研究样本中微生物群落组成结构的重要手段。

 

      实验及服务流程:

      

     售前咨询→样本采集→样本质控→DNA提取→PCR扩增→产物纯化→文库构建→Illumina测序仪测序→数据分析→报告发送→售后支持

 

      结果示例图:

 

物种丰度聚类图

(横向为样本名称,纵向为物种注释名称,图中左侧的聚类树为物种聚类树。)

 

花瓣图

(图中每个椭圆代表一个样本,椭圆和椭圆重叠部分的数字代表样本之间共有的扩增序列变体ASVs个数,没有重叠部分的数字代表样本的特有ASVs个数。)

 

三元相图

(图中三个顶点代表三个样本,圆圈代表物种,圆圈大小和相对丰度成正比,圆圈离某个顶点越接近,表示此物种在该样本中含量越高。)

 

Alpha多样性物种累计箱形图

(横坐标为样本量,纵坐标为抽样后ASVs的数目,整体结果反映了持续抽样下新ASVs出现的速率。物种累积箱形图可以用于判断样本量是否充分,若箱形图位置急剧上升表明样本量不足,需要增加抽样量;反之,则表明抽样充分,可以进行数据分析。)

MetaStat组间物种差异分析

(横轴代表分组,纵轴代表显著差异性物种在样本中的绝对丰度,每个点代表一个样本,不同颜色的箱形代表不同的分组。)

 

 

T-test组间功能差异分析

(左图为组间差异功能展示,图中每个条形代表在不同分组间的差异功能的丰度平均值;右图为组间差异置信度展示。圆圈的圈心代表的是均值差,而颜色代表对应差异功能的组间差异显著检验P值。)

 

 

火山图

(横轴是比较组差异功能的倍数差异,而纵轴则是差异功能的组间显著差异检验P值。图中每个点代表一个差异功能,其中Up代表该差异功能在第一个比较组中的丰度高于第二个比较组,而Down则相反。)

 

       应用领域:

  

        1.  医学领域:疾病与人体微生物间关系,如肠道微生物与疾病研究等;

        2. 环境领域:特定环境的微生物群落组成,如污水治理及海洋环境等微生物群落分布和组成等;

        3. 畜牧领域:消化道微生物群落与动物生长发育以及营养健康等;

        4. 生物能源:特殊功能的工程菌的开发等;

        5. 农业领域:微生物与植物互作等;

       

        更多应用领域及其他技术问题,详情请咨询售前技术支持,联系电话/微信:17349797961 

 

 

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