WGSplus™ | 全基因组检测分析

 

 

      WGSplus™ | 全基因组检测分析，高通量全面分析基因组，发现全基因组DNA变异与复杂疾病的关联。

       

      全基因组重测序（Whole Genome Sequencing, WGS）是利用Illumina测序平台对研究对象进行全基因组测序，并进行生物信息分析。人全基因组重测序可全面挖掘基因组的SNP/InDel/CNV/SV等各类变异，为筛选疾病的致病及易感基因， 研究发病及遗传机制提供重要信息。

 

     实验及服务流程：

      

     售前咨询→样本采集→样本质控→DNA提取→文库构建→Illumina测序仪测序→数据分析→报告发送→售后支持

 

     结果示例图：     

 

 

Circos图

（由外到内，最外圈是染色体信息；第2环，测序覆盖度图（蓝色）；第3环，黑色圆点表示 InDel 的密度，高低表示密度大小；第4环，绿色圆点表示SNP的密度，高低表示大小；第5环，纯合 SNP（橙色）和杂合SNP（灰色）的比例；第6环，Control-FREEC分析结果，红色为CNV扩增，绿色为CNV缺失；第7环，LUMPY结果，其中染色体间易位CTX（橙色 ）、插入INS （绿色）、删除DEL（灰色 ）、染色体内易位ITX（粉红色）和倒位 INV（蓝色）。）

 

 

染色体的覆盖深度和覆盖率图

（横坐标表示染色体编号，左侧纵坐标表示平均覆盖深度，右侧纵坐标表示覆盖率。）

 

 

InDel长度分布图

（横坐标代表InDel的长度（+为插入，-为缺失），纵坐标代表长度为x的InDel在所有InDel中的比例。nCDS代表非编码区域，CDS代表编码区域。）

 

 

KEGG通路富集的散点图

（横坐标表示富集在通路中的gene占总的富集基因的比例，纵坐标表示富集的KEGG通路名称。圆点大小表示富集到该通路的基因个数，颜色表示p-value。）

 

 

关联分析曼哈顿图

（横坐标为基因组坐标，纵坐标为-log10P，P值越小关联性越强，表现为纵坐标越大。）

 

 

        应用领域：

  

        1.  肿瘤疾病治疗靶点研究

        2. 人类遗传学和群体进化学的研究

        3. 动物性状与群体进化研究

        4. 植物分子育种、功能和进化研究

       

        更多应用领域及其他技术问题，详情请咨询售前技术支持，联系电话/微信：17349797961